Ivan Ajdnik se je rodil 22. aprila 1950 v Slovenski Bistrici očetu Ivanu Ajdniku in materi Marici Ajdnik, rojeni Štern. Ima eno sestro.
Osnovno šolo je obiskoval v Slovenski Bistrici in šolanje nadaljeval na 2. gimnaziji v Mariboru. Po uspešno opravljeni maturi je študiral na Filozofski fakulteti v Ljubljani na oddelku za enopredmetno psihologijo in si pridobil izobrazbo univerzitetni diplomirani psiholog.
25. decembra 1976 se je poročil z Boženo Ajdnik, rojeno Jezernik. V zakonu sta se jima rodili hčerki Katja in Barbara.
Njegova prva zaposlitev je bila na Celodnevni osnovni šoli v Poljčanah. Po odsluženju vojaškega roka, maja 1978, se je zaposlil na Občinski izobraževalni skupnosti Slovenska Bistrica kot psiholog strokovnega tima v šolski svetovalni službi, za potrebe osnovnih šol občine Slovenska Bistrica. Leta 1980 se je strokovni tim dveh psihologov in enega pedagoga priključil OŠ Pohorskega odreda Slovenska Bistrica, kjer so še naprej izvajali šolsko svetovalno delo za potrebe osnovnih šol občine. V tem času je bil izbran za vodjo strokovnega tima šolskih svetovalnih delavcev, leta 1986 je bil imenovan za pomočnika ravnatelja na OŠ Pohorskega odreda, 1. aprila 1992 pa tudi za njenega ravnatelja.
Pouk na OŠ Pohorskega odreda so izvajali za več kot 1500 učencev, po 5 oddelkov v vsakem razredu, poleg tega pa še na Podružnični OŠ Zgornja Ložnica od 1. do 6. razreda, za okoli 90 in občasno tudi več učencev, kar je predstavljalo izjemno prostorsko stisko. Zaradi prostorske stiske so imeli težave pri postopnem uvajanju 9 – letne osnovne šole, čeprav so bili učitelji in drugi strokovni delavci strokovno pripravljeni na prehod. Opozarjali so občino, da bi morali v mestu zgraditi še eno osnovno šolo, kar je pokazala tudi občinska študija šolskega prostora. Tako so se mestne krajevne skupnosti skupaj z občino odločile, da bodo poleg ministrstva za šolstvo zagotovili potrebna finančna sredstva. Temeljni kamen za gradnjo 2. osnovne je bil položen aprila 2007, pouk v njej pa se je začel 1. septembra 2008.
V času, ko je OŠ Pohorskega odreda vodil Ivan Ajdnik, so dosegli številne uspehe na različnih tekmovanjih, glede na športne dosežke je bila »njegova« šola izbrana za najbolj športno šolo v državi. Pridobili so tudi naziv kulturna šola. Sodelovali so v številnih projektih, med katerimi je še posebej pomemben projekt Comenius, kjer so sodelovali s številnimi državami v EU. Pri pedagoškem vodenju šole je dajal poseben poudarek delu z učenci, strokovnemu izpopolnjevanju, dobremu medsebojnem sodelovanju z učitelji, s starši ter lokalno skupnostjo. Učitelji in drugi strokovni delavci so imeli možnost izbire različnih strokovnih izobraževanj. Da so na šoli delali strokovno, so potrdile izbire Zavoda za šolstvo OE Maribor, ki so med njihovimi učitelji izbrali več vodij študijskih skupin.
Ivan Ajdnik se je upokojil 1. junija 2012, po več kot dvajsetih letih uspešnega vodenja šole.